Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prpf4bQ61136 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4bQ61136 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf4bQ61136 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms