Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp1r1bQ60829 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp1r1bQ60829 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp1r1bQ60829 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms