Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mkrn3Q60764 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mkrn3Q60764 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms