Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyb561Q60720 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyb561Q60720 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyb561Q60720 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms