Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM104BQ5XKR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM104BQ5XKR9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM104BQ5XKR9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms