Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD20A3Q5VUR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD20A3Q5VUR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD20A3Q5VUR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms