Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38BQ5VTL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF38BQ5VTL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38BQ5VTL8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms