Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR78Q5VTH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR78Q5VTH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR78Q5VTH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms