Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKAP1Q5VSY0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms