Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl6Q5U3K5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl6Q5U3K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabl6Q5U3K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms