Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO4Q5TGY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO4Q5TGY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms