Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERCC6L2Q5T890 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6L2Q5T890 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
ERCC6L2Q5T890 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ERCC6L2Q5T890 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERCC6L2Q5T890 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6L2Q5T890 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6L2Q5T890 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms