Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFAP70Q5T0N1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFAP70Q5T0N1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP70Q5T0N1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP70Q5T0N1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFAP70Q5T0N1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms