Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL5A1-AS1Q5SY13 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms