Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mks1Q5SW45 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mks1Q5SW45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms