Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3CD-AS1Q5SR53 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms