Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAT1Q5SQI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ATAT1Q5SQI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAT1Q5SQI0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAT1Q5SQI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAT1Q5SQI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAT1Q5SQI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356.6 ms