Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM48Q5RL73 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM48Q5RL73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms