Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RilpQ5ND29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RilpQ5ND29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RilpQ5ND29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms