Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rapgef6Q5NCJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms