Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc1Q5NCF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc1Q5NCF2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms