Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPANXN3Q5MJ09 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms