Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp28Q5I043 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Usp28Q5I043 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms