Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL2Q5HYW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHSL2Q5HYW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHSL2Q5HYW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHSL2Q5HYW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHSL2Q5HYW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms