Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC4Q5GLZ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HERC4Q5GLZ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms