Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF542PQ5EBM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF542PQ5EBM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms