Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp22Q5DU02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp22Q5DU02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp22Q5DU02 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms