Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ODF2Q5BJF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ODF2Q5BJF6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODF2Q5BJF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms