Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AA4PQ58FG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AA4PQ58FG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AA4PQ58FG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AA4PQ58FG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AA4PQ58FG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSP90AA4PQ58FG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms