Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC92Q53HC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms