Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC2HC1CQ53FD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC2HC1CQ53FD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZC2HC1CQ53FD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC2HC1CQ53FD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC2HC1CQ53FD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms