Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srrm1Q52KI8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srrm1Q52KI8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srrm1Q52KI8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srrm1Q52KI8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms