Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KHDC1Q4VXA5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KHDC1Q4VXA5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms