Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP28Q4G0W2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP28Q4G0W2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUSP28Q4G0W2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP28Q4G0W2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DUSP28Q4G0W2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms