Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prpf38aQ4FK66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf38aQ4FK66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf38aQ4FK66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms