Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB8Q3ZCM7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB8Q3ZCM7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms