Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700123L14RikQ3V2K7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700123L14RikQ3V2K7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700123L14RikQ3V2K7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700123L14RikQ3V2K7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700123L14RikQ3V2K7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms