Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ulk4Q3V129 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ulk4Q3V129 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ulk4Q3V129 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194 ms