Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc110Q3V125 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc110Q3V125 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms