Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm44Q3V089 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm44Q3V089 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm44Q3V089 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm44Q3V089 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms