Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc27Q3V036 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc27Q3V036 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc27Q3V036 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc27Q3V036 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms