Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5aQ3UXZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5aQ3UXZ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5aQ3UXZ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm5aQ3UXZ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm5aQ3UXZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms