Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thsd4Q3UTY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thsd4Q3UTY6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thsd4Q3UTY6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms