Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim15Q3UTD9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms