Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubtfl1Q3USZ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubtfl1Q3USZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms