Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SfswapQ3USH5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SfswapQ3USH5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SfswapQ3USH5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SfswapQ3USH5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SfswapQ3USH5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms