Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmprss11aQ3UQ41 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmprss11aQ3UQ41 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss11aQ3UQ41 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmprss11aQ3UQ41 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmprss11aQ3UQ41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms