Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec31aQ3UPL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31aQ3UPL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sec31aQ3UPL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec31aQ3UPL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
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