Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnrc6cQ3UHC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tnrc6cQ3UHC0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6cQ3UHC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnrc6cQ3UHC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6cQ3UHC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnrc6cQ3UHC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms