Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp8Q3UD82 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp8Q3UD82 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp8Q3UD82 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms